Diposting Kamis, 9 September 2010 jam 12:12 am oleh Gun HS

Konsorsium Penelitian bagi Pengurutan Genom Kalkun Ternak

Suka dengan artikel ini?

Jelajahi artikel-artikel FaktaIlmiah yang berdasarkan apa yang dibaca dan ditonton teman-teman.
Terbitkan aktivitas Anda sendiri dan dapatkan kendali penuh.
Login

Kamis, 9 September 2010 -


Sebuah konsorsium peneliti internasional telah menyelesaikan sebagian dari urutan genom dari kalkun ternak, yang akan dipublikasikan dalam jurnal online PLoS Biology. Pada tahun 2008, konsorsium penelitian dibentuk untuk memetakan cetak biru genetik bagi kalkun ternak, sumber keempat daging paling populer di Amerika Serikat. Urutan genom lengkap, cepat diperoleh dengan menggunakan teknologi sekuensing ‘next-generation‘, menjanjikan data baru bagi para peneliti unggas dan, akhirnya, produk berkualitas yang lebih baik bagi produsen dan konsumen kalkun.

“Untuk saat ini, lebih dari 90 persen dari genom kalkun ternak telah diurutkan dan dikumpulkan,” kata Rami Dalloul, asisten profesor ilmu hewan dan unggas di Virginia Tech’s College of Agriculture and Life Sciences. Sebagian besar data berasal dari 10 kromosom terbesar, disebut makrokromosom, dan para peneliti dalam konsorsium masih mencari rute terbaik untuk urutan makrokromosom yang tersisa. “Kita sudah membahas ribuan gen yang tidak diketahui sebelumnya pada para ilmuwan unggas,” kata Dalloul. Yang juga menarik adalah urutan kromosom seks “Z” dan “W”, yang tak terungkap di masa lalu.

Clive Evans, direktur Core Laboratory Facility at the Virginia Bioinformatics Institute (VBI), mengatakan, “Ketersediaan teknologi sekuensing Roche GS-FLX™ Titanium di VBI memudahkan konsorsium penelitian kalkun membentuk draft awal genom kalkun dengan cepat dan efisien. “Draft ini diperpanjang pada tahun 2009 dengan data dari platform sekuensing Illumina di USDA-Agricultural Research Service dan dikumpulkan oleh para ilmuwan di Universitas Maryland untuk menghasilkan perakitan genom saat ini. Penggunaan teknologi sekuensing next-generation ini berarti bahwa urutan genom kalkun telah diperoleh dari sebagian kecil biaya memproduksi perakitan genom ayam hutan merah (spesies yang sama dengan ayam ternak) pada tahun 2004.

“Dalam jangka pendek, urutan genom kalkun akan memberikan para ilmuwan pengetahuan gen khusus yang penting untuk hasil dan kualitas daging, sehat dan tahan penyakit, subur, dan reproduksi,” kata Dalloul. “Sebagai contoh, kita tidak selalu tahu bagaimana mekanisme kerja interaksi patogen-inang. Urutan genom akan memungkinkan kita untuk lebih memahami proses ini, yang pada gilirannya akan memberikan kita pemahaman yang lebih baik tentang pencegahan penyakit dan perawatan.”

Peningkatan pemahaman variasi genetik dalam spesies ini dan dalam populasi pengembangbiakan juga akan mengarah pada pengembangan alat-alat baru yang dapat digunakan produsen untuk mengembangbiakan kalkun dengan tekstur, rasa, dan lemak yang diinginkan, dan tentunya secara langsung akan berdampak pada produk bagi konsumen.

Selain itu, urutan genom mungkin memiliki aplikasi dalam bidang biomedis. Ed Smith, profesor ilmu hewan dan unggas di Virginia Tech, menyelidiki kondisi unggas mirip dengan cardiomyopathy membesar pada manusia. Anggota konsorsium lain – Roger Coulombe di Universitas Utah State dan Kent Reed di Universitas Minnesota – sedang mempelajari dampak aflatoksin terhadap kalkun. Aflatoksin merupakan bahan kimia karsinogenik alami yang dihasilkan oleh jamur, yang menekan sistem kekebalan. Kalkun ternak dikenal sebagai spesies yang paling rentan terhadap aflatoksin.

Konsorsium internasional tahun lalu mencatat dan menganalisa konsep urutan genom, yang memuncak dalam “menyempurnakan kerumitan cetak biru genetik kalkun seperti yang dijelaskan secara rinci dalam paper PLoS Biologi,” kata Evans. Tim peneliti berharap pendekatan terpadu yang digunakan untuk memperoleh genom kalkun ini akan menyediakan model untuk menciptakan rakitan level gen – dan kromosom – bagi spesies lain demi kepentingan agrikultural, ekologi, atau evolusi.

Sumber: esciencenews.com

Gun HS
There's only one thing I figured about myself: Complex
Bergabung dengan 1000 orang lebih dengan kami melalui sosial media

Berlangganan artikel dan berita terbaru dari kami via email


Aktifitas

© 2010 FaktaIlmiah.com. Hak cipta asli oleh faktailmiah
Anda boleh mendistribusikannya dengan mencantumkan referensi dari situs kami.